个人简介
2010年和2015年于北京大学化学与分子工程学院分别获得学士和博士学位。先后在哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究所、牛津大学Nuffield医学院Ludwig癌症研究所担任博士后研究员。作为共同创始人在牛津大学科研转化平台上创建了癌症早筛公司Base Genomics，被纳斯达克上市企业Exact Sciences收购后担任AssociateDirector。2020年12月入选国家海外高层次人才引进青年项目。现任武汉大学化学与分子科学学院教授及泰康生命医学中心PI。
教育经历
2006.9-2010.7北京大学化学与分子工程学院学士
2010.9-2015.6 北京大学化学与分子工程学院博士
工作经历
2015.6-2016.8哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究所 博士后
2016.8-2017.7Genefirst Ltd高级科学家
2017.7-2020.3牛津大学Nuffield医学院Ludwig癌症研究所 博士后
2020.3-2020.10Base Genomics 共同创始人
2020.10-2022.8Exact Sciences AssociateDirector
2022.9-至今 武汉大学化学与分子科学学院教授/博导 泰康生命医学中心PI
荣誉奖励
2019年国家海外高层次人才引进青年项目
科研领域
DNA甲基化作为表观遗传学的重要现象之一，在胚胎发育等生命过程中起着重要的调控作用，并且与癌症等多种疾病密切相关。传统的亚硫酸氢钠测序法(BS-Seq)是目前DNA甲基化检测的金标准，然而其缺点也十分突出，比如剧烈的反应条件损伤DNA、转化后序列的复杂性差降低覆盖率。我的研究兴趣是采用化学和生物化学的方法开发针对DNA甲基化分析的新技术，应用于以癌症早筛为主的相关生物医学研究领域。我们此前开发的TET酶氧化的吡啶硼烷测序法(TAPS)，在测序起始量、测序成本和测序数据质量等方面都具有明显优势，有望替代BS-Seq成为DNA甲基化检测新的金标准，目前已经实现了商业转化。研究方向包括：
1.单细胞多组学方法用于癌症基础医学研究
2.基于异常DNA甲基化和羟甲基化检测的癌症早期诊断技术的开发
3.新型测序平台（例如第三代单分子长读长测序）在癌症诊断方面的应用
代表性论文
Yibin Liu#, Paulina Siejka-Zielińska#, Gergana Velikova, Ying Bi, Fang Yuan, Marketa Tomkova, Chunsen Bai, Lei Chen, Benjamin Schuster-Böckler*, Chun-Xiao Song*.Bisulfite-free direct detection of 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine at base resolution. Nature biotechnology, 2019, 37, 424-429
Yibin Liu#, Chen Song, Ioannis Ladas, Mariana Fitarelli-Kiehl, G Mike Makrigiorgos*. Methylation-sensitive enrichment of minor DNA alleles using a double-strand DNA-specific nuclease.Nucleic acids research, 2017, 45, e39
Yibin Liu#, Zhiyuan Hu#, Jingfei Cheng, Paulina Siejka-Zielińska, Jinfeng Chen, Masato Inoue, Ahmed Ashour Ahmed, Chun-Xiao Song*. Subtraction-free and bisulfite-free specific sequencing of 5-methylcytosine and its oxidized derivatives at base resolution. Nature communications, 2021, 12, 618
Yibin Liu#, Jingfei Cheng#, Paulina Siejka-Zielińska, Carika Weldon, Hannah Roberts, Maria Lopopolo, Andrea Magri, Valentina D’Arienzo, James M Harris, Jane A McKeating, Chun-Xiao Song*. Accurate targeted long-read DNA methylation and hydroxymethylation sequencing with TAPS. Genome biology, 2020, 21, 54
Yibin Liu#, Simin Fang, Junqiu Zhai, Meiping Zhao*. Construction of antibody-like nanoparticles for selective protein sequestration in living cells. Nanoscale, 2015, 7, 7162-7167
