个人简介
个人介绍
1972年8月出生,中国科学院上海生物化学研究所生物化学专业博士,美国爱因斯坦医学院细胞生物学博士后,现任武汉大学生命科学院生物化学系教授。长期从事RNA生物学研究,在RNA剪接的发生机制及其参与调控的重要发育与疾病研究领域取得了一系列研究成果。先后获得国家自然科学基金委、中国科学院、科技部等多个人才与科研项目资助。
教育经历
1989.09-1996.07 安徽农业大学 本科、硕士
1996.09-1999.11 中国科学院上海生物化学研究所 博士
工作经历
1999.11-2000.03 中国科学院上海生物化学研究所 研究助理
2000.03-2008.07 美国爱因斯坦医学院细胞生物学系 博士后、研究助理
2008.08-2018.08 中国科学院上海生命科学研究院 研究员、课题组长
2018.09-2020.11 武汉大学生命科学学院生物化学系 教授、系主任
2020.11-至 今 武汉大学生命科学学院 教授、副院长
荣誉奖励
2007年美国爱因斯坦医学院“杰出博士后”奖
2009年入选上海市“浦江人才”
2009年择优入选中科院“百人计划”
2015年获得国家自然科学基金委“国家杰出青年科学基金”项目资助
社会服务
2021年至今 中国生物物理学会理事
2012年至今 中国生物化学与分子生物学会RNA专业委员会委员
2018年至今 Science Bulletin杂志生物学副主编
2020年至今 武汉大学RNA生物学研究所负责人
科研领域
高等生物具有数量众多的内含子,如人类基因组中内含子数量超过30万个。内含子的去除需要通过大分子复合物剪接体的精准催化完成,是转录后RNA加工的必需步骤和基因表达调控的重要手段。RNA剪接具有多样性和复杂性,与细胞分化、器官发育等生命过程密切相关,剪接紊乱则是导致多种疾病发生的重要原因。
以发育和疾病中RNA剪接多样性与复杂性为研究重点,研究方向包括:1)RNA剪接多样性的发生机制; 2)神经、代谢和肿瘤等疾病中的RNA剪接调控;3)果蝇性别和器官发育的RNA剪接调控。
在研课题包括:1)内含子中跨物种高度保守的顺式作用元件对器官发育、能量代谢的调控机制;2)次要剪接体的组装及其敏感基因在神经退行性疾病中的作用;3)前列腺癌药物治疗过程中雄性激素受体的选择性剪接紊乱机制;4)基于剪接因子高频突变的血液性疾病(MDS, CLL等)早期诊断方法研究。
代表性论文
Ding Z, Meng YR, Fan YJ andXu YZ*(2022) Roles of minor spliceosome in intron recognition and the convergence with the better understood major spliceosome. WIREs RNADOI: 10.1002/wrna.1761 (advance review).
Zhang B#, Ding Z#, Li L, Xie LK, Fan YJ andXu YZ*(2021) Two oppositely-chargedsf3b1mutations cause defective development, impaired immune response, and aberrant selection of intronic branch sites inDrosophila.PLoS Genetics17(11): e1009861.
Li L#, Ding Z, Pang TL, Zhang B, Li CH, Liang AM, Wang YR, Zhou Y, Fan YJ* andXu YZ*(2020) Defective minor spliceosomes induce SMA-associated phenotypes through sensitive intron-containing neural genes inDrosophila.Nature Communications, 11(1): 5608. Recommended in “From Brain to Behaviour”.
Shao W, Ding Z, Zheng ZZ, Shen JJ, Shen YX, Pu J, Fan YJ, Query CC* andXu YZ* (2020)Prp5–Spt8/Spt3 Interaction Mediates a Reciprocal Coupling between Splicing and Transcription.Nucleic Acids Research48(11): 5799-5813. Selected as “Breakthrough Article”.
Zheng ZZ, Sun X, Zhang B, Pu J, Jiang ZY, Li M, Fan YJ andXu YZ*(2019)Alternative splicing regulation of doublesex gene by RNA-binding proteins in the silkwormBombyx mori.RNA Biology16(6):809-820.
Tang Q#, Rodriguez-Santiago S#, Wang J, Pu J, Yuste A, Gupta V, Moldón A,Xu YZ*and Query CC*(2016) SF3B1/Hsh155 HEAT motif mutations affect interaction with the spliceosomal ATPase Prp5, resulting in altered branch site selectivity in pre-mRNA splicing.Genes & Development30(24): 2710-2723.
Gao JL#, Fan YJ#, Wang XY#, Zhang Y, Pu J, Li L, Shao W, Zhan S, Hao J andXu YZ*(2015) A conserved intronic U1 snRNP-binding sequence promotestrans-splicing inDrosophila.Genes & Development29(7): 760-771.
Zhang ZM#, Yang F#, Zhang J, Tang Q, Li J, Gu J, Zhou J* andXu YZ*(2013) Crystal structure of Prp5p reveals interdomain interactions that impact spliceosome assembly.Cell Reports5, 1269-1278.
Yang F, Wang XY, Zhang ZM, Pu J, Fan YJ, Zhou J, Query CC andXu YZ*(2013) Splicing proofreading at 5' splice sites by ATPase Prp28p.Nucleic Acids Research41(8), 4660-4670.
实验室简介
目前实验室有副研究员1名,博士生11名,硕士生7名。
实验室英文网址:https://xu-lab-whu.github.io/index.html